Muv-Luv ATE全名为《Muv-Luv Alternative Total eclipse 》，全集动画片改编自《Muv-Luv Alternative》的外传小说。故事的时间设定在西元2001年，由于人类遭到地球外起源种(联合国称其为BETA)的侵略，正面临灭亡的危机，因此人类开始了先进战术机技术开发计划“XFJ计划”，各个国家均派遣了专门人员参与其中，该作讲述的就是这些被派遣过来的人员之间的故事。（有虫子吃掉妹纸情节,反差极大,请谨慎观看.）
这次的敌人，为了在电视系列最后展开大激斗的安培拉星人而秘密制作了传说之铠甲：暗黑铠甲。 发挥安培拉星人级的蛮力和魔力的这件铠甲为何会开始活动？ 另外，身穿铠甲的是人是谁，而且，他的目的是什么？ 谜中谜呼之欲出展开中，加入奥特兄弟的年轻勇者·梦比优斯和相原 龙率领GREW GUYS再次合力，挑战暗黑铠甲。 加上新队员加入CREW GUYS，以五十岚隼士饰日比野未来为首的迷友们所熟悉的电视系列正式演出者共同出演描绘这次的故事，梦比优斯等人和暗黑铠甲之间的白热化的攻防战，分成两卷描写。
在遥远的神话时代，冥王哈迪斯曾率领108冥斗士向人类世界发起攻击，智慧女神雅典娜则率圣斗士们奋起迎敌。连番苦战之后，哈迪斯及其军团战败，他们全部被雅典娜封印，而圣斗士也几乎损伤殆尽。数千年后，女神的封印失去效力，古塔中的冥斗士又重新蠢蠢欲动。复活后的哈迪斯及其冥斗士将魔爪伸向圣域。连番恶战，圣域几近毁灭。参透阿赖耶识的处女座圣斗士沙加和女神雅典娜以活体闯入冥界。青铜5人组以女神之血修复业已破损的圣衣，随后闯入潘多拉城。战场移到黑暗的冥界，一场绵亘了数千年的正邪大战就此展开……
玉木真理（水濑祈 配音）是就读于多多良西高中二年级的女生，生性活泼开朗的她是一个容易对新鲜事物产生好奇心的女孩，但是本性中的谨慎和胆小又让她对这些事物往往浅尝辄止，无法深入。这一天，真理邂逅了名为小渕泽报濑（花泽香菜 配音）的同学，她的母亲是一名南极观测队队员，因此，从 很小的时候起，真理就对南极这片冰封的土地充满了好奇。在报濑的影响下，真理开始向往踏上南极的土地。性格开朗在便利店打工的三宅日向（井口裕香 配音）、虽然年龄小但意外的老成的白石结月（早见沙织 配音），在“南极Challenge”的队长藤堂吟（能登麻美子 配音）的带领下，少女们向着梦想开始了进发。
故事讲述无聊的神明们制作了一个终极益智游戏《诸神的游戏》，从冰里长眠3000年，热爱游戏的前神明少女レオレーシェ苏醒后做出宣言，「带上这个时代最会玩的人！」，而被指名的フェイ是备受期待成为「近年最强的新人」的使徒，两人共同挑战难度极大且还没有人类能完全攻略的《诸神的游戏》。天才游戏少年、前神明少女与伙伴们就此展开和至高神明的终极脑力大战！
讲述因抱错婴儿，让就读名门私立学校的男子高中生「海野凪」与酒店总裁千金「天野绘里香」被父母订下婚约，但凪暗恋着「濑川弥」，而凪的妹妹也对他有着不一样的心情，因此展开一场四角关系的恋爱喜剧。
平凡的高中生相川步，在莫名其妙的因缘下被卷入震惊社会的连环杀人案中身亡，但他竟然死而复生了。原来在事件发生之前与步偶然邂逅的死灵法师优，将他变成了僵尸而复活。再加上来自魔法世界的少女战士春奈，与另一个吸血忍者少女瑟拉，甚至演变成步跟她们全同居在一起的局面……
“通灵王（SHAMAN KING）”那是掌管森罗万象的星球之王。能够与神明或灵体交流、被称作「通灵人」的人们，在500年一度的「通灵人大战」当中争夺这一宝座。这些通灵人其中之一的少年·麻仓叶以通灵王为目标的战斗，2021年4月，以完全新作动画的形式就此展开。
